Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDH10Q9P2E7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDH10Q9P2E7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms