Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDP1Q9P0J1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms