Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms