Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A12Q9NXJ0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A12Q9NXJ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms