Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CNTLNQ9NXG0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CNTLNQ9NXG0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CNTLNQ9NXG0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms