Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD3Q9NX63 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD3Q9NX63 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms