Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFRSF19Q9NS68 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms