Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASS4Q9NQ75 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASS4Q9NQ75 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms