Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IL1RAPQ9NPH3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL1RAPQ9NPH3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms