Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBX8Q9HC52 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CBX8Q9HC52 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms