Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LGR6Q9HBX8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LGR6Q9HBX8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LGR6Q9HBX8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LGR6Q9HBX8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LGR6Q9HBX8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LGR6Q9HBX8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
LGR6Q9HBX8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LGR6Q9HBX8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LGR6Q9HBX8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms