Protein–RNA interactions for Protein: Q9H944

MED20, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED20Q9H944 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED20Q9H944 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MED20Q9H944 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED20Q9H944 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms