Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A4Q9H015 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC22A4Q9H015 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC22A4Q9H015 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A4Q9H015 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A4Q9H015 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A4Q9H015 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A4Q9H015 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A4Q9H015 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A4Q9H015 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A4Q9H015 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A4Q9H015 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A4Q9H015 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A4Q9H015 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A4Q9H015 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A4Q9H015 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A4Q9H015 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A4Q9H015 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A4Q9H015 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms