Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN6

SLC6A16, Orphan sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter NTT5, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A16Q9GZN6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A16Q9GZN6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A16Q9GZN6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A16Q9GZN6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A16Q9GZN6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A16Q9GZN6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A16Q9GZN6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A16Q9GZN6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms