Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCLK3Q9C098 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms