Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP9-8Q9BYQ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms