Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SYCP2Q9BX26 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYCP2Q9BX26 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SYCP2Q9BX26 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms