Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
THUMPD3Q9BV44 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms