Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLF1Q9BQI6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLF1Q9BQI6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLF1Q9BQI6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms