Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRRT1Q99946 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms