Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA3Q99618 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA3Q99618 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms