Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PIK3R4Q99570 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PIK3R4Q99570 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PIK3R4Q99570 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms