Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEPDC7Q96QD5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms