Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ALS2Q96Q42 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ALS2Q96Q42 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms