Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SORCS2Q96PQ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SORCS2Q96PQ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORCS2Q96PQ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms