Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD27Q96NW4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD27Q96NW4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD27Q96NW4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD27Q96NW4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD27Q96NW4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD27Q96NW4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD27Q96NW4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD27Q96NW4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD27Q96NW4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD27Q96NW4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms