Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00167Q96N53 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms