Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SENP8Q96LD8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SENP8Q96LD8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms