Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLMNQ96JQ2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms