Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
BCANQ96GW7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
BCANQ96GW7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms