Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF31Q8WWY3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PRPF31Q8WWY3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF31Q8WWY3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF31Q8WWY3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms