Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNRF4Q8WWF5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF4Q8WWF5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms