Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJA4Q8WW22 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJA4Q8WW22 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms