Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHD5Q8TDI0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CHD5Q8TDI0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms