Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAE3

LINC01555, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01555, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01555Q8NAE3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC01555Q8NAE3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC01555Q8NAE3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC01555Q8NAE3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC01555Q8NAE3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC01555Q8NAE3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC01555Q8NAE3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC01555Q8NAE3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC01555Q8NAE3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC01555Q8NAE3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC01555Q8NAE3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC01555Q8NAE3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC01555Q8NAE3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC01555Q8NAE3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC01555Q8NAE3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC01555Q8NAE3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC01555Q8NAE3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC01555Q8NAE3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC01555Q8NAE3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms