Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9N7

LRRC57, Leucine-rich repeat-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC57Q8N9N7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC57Q8N9N7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC57Q8N9N7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms