Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC18Q8N456 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LRRC18Q8N456 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC18Q8N456 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC18Q8N456 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRRC18Q8N456 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRRC18Q8N456 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRRC18Q8N456 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRRC18Q8N456 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms