Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC43Q8N309 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC43Q8N309 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms