Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HACE1Q8IYU2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HACE1Q8IYU2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HACE1Q8IYU2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms