Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYB3

SRRM1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 904 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM1Q8IYB3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRRM1Q8IYB3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRM1Q8IYB3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRM1Q8IYB3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms