Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMNTD2Q8IXW0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms