Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXV7

KLHDC8B, Kelch domain-containing protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC8BQ8IXV7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC8BQ8IXV7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHDC8BQ8IXV7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC8BQ8IXV7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms