Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SFTPA2Q8IWL1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms