Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGDCC3Q8IVU1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IGDCC3Q8IVU1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms