Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP9

LHFPL3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL3Q86UP9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHFPL3Q86UP9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms