Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KRT28Q7Z3Y7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
KRT28Q7Z3Y7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KRT28Q7Z3Y7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KRT28Q7Z3Y7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KRT28Q7Z3Y7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KRT28Q7Z3Y7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
KRT28Q7Z3Y7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KRT28Q7Z3Y7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
KRT28Q7Z3Y7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KRT28Q7Z3Y7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KRT28Q7Z3Y7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KRT28Q7Z3Y7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KRT28Q7Z3Y7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms