Protein–RNA interactions for Protein: Q71SY5

MED25, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 25, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED25Q71SY5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED25Q71SY5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED25Q71SY5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED25Q71SY5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED25Q71SY5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED25Q71SY5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED25Q71SY5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED25Q71SY5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED25Q71SY5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED25Q71SY5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED25Q71SY5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MED25Q71SY5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED25Q71SY5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED25Q71SY5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED25Q71SY5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED25Q71SY5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED25Q71SY5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED25Q71SY5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED25Q71SY5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED25Q71SY5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED25Q71SY5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED25Q71SY5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED25Q71SY5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED25Q71SY5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED25Q71SY5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED25Q71SY5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms