Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC171Q6TFL3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC171Q6TFL3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms