Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED27Q6P2C8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms