Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV1

RPL13AP3, Putative 60S ribosomal protein L13a protein RPL13AP3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP3Q6NVV1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL13AP3Q6NVV1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL13AP3Q6NVV1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms